BPH merupakan Badan Pengawas Harian, bertanggung jawab terhadap pelaksanaan semua kegiatan setiap divisi, juga bertanggung jawab dalam pelaksanaan kaderisasi staff BEM. Seperti halnya laporan dalam divisi antara anggota dengan ketua divisi-nya, laporan dari setiap ketua divisi untuk dilaporkan kepada ketua BEM beserta wakil ketua BEM, Badan Pengawas Harian juga harus tahu seluk beluk dari setiap divisi yang dibawahi.

Pembagian BPH dalam struktur BEM Universitas MH. Thamrin yaitu:

1. BPH Divisi Pendidikan AE dan Divisi Pendidikan AKP
2. BPH Divisi Kesenian dan Divisi Komunikasi
3. BPH Divisi Rohani Islam dan Divisi Rohani Kristen
4. BPH Divisi Dana Usaha
5. BPH Divisi Olahraga dan Divisi Pertahanan